Contents
Working directories
- Great! Worked on Vision.
miR in HSV-1 exosomes
Goal
伪代码/Pseudo Code
- 外泌体包含miR的功能
- 选择病毒感染形成外泌体中包含的miR并分析其功能
- 分别讨论宿主端和病毒端miR的功能
Host side
- Clean.fa中排除HSV-1序列,获得宿主侧序列集合(Host set)
- 宿主侧序列集合(Host set)中排除miR序列,获得宿主侧非 miR序列集合(Host set miR free)
- 宿主侧序列集合中miR序列确认,获得宿主侧非miR序列集合(Host miR set)
- 宿主侧非 miR序列集合(Host set miR free)以及宿主侧非miR序列集合(Host miR set)比较分析,即,HSV-1感染条件下与非感染条件下的数据比较
Virus side
- Clean.fa中包含与HSV-1一致的序列,获得病毒侧序列集合(Viral set)
- 病毒侧序列集合(Viral set)中排除miR序列,获得病毒侧非 miR序列集合(Viral set miR free),该集合中应该存在新的HSV-1编码的miR
- 病毒侧序列集合(Viral set)中保有miR序列,获得病毒侧非miR序列集合(Viral miR set)
- 按照前述宿主侧序列的比较方式进行分析